ЦМД - династия и её научное наследие...

Собираем информацию о диагностике, лечении, координаты клиник, врачей, лабораторий, полезные ссылки
Ответить
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

немного юмора:
viewtopic.php?f=26&t=18482&p=1117953#p1117953
Тело писал(а):Сегодня забрал четырехнедельный ПЦР из Боткина, они пошли еще дальше, чем мог себе представить Виртуоз чуйка на качестве теперь 5МЕ
пс. Какие тест-наборы по прежнему непонятно, но хорошо хоть оборудование указали ))
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

vvp писал(а):В этих шведских тезисах, в первую очередь, нужно обратить внимание на результаты тестирования международных стандартов NIBSC, которые во всем мире используются для валидации чувствительности тестов.
В этой связи хотелось бы дополнить выводы по шведскому исследованию качественного набора АмплиСенс, которое приведено на. стр. 4 данной ветки.
Ссылку на само исследование и краткие выводы к нем дублирую для удобства ниже:
https://www.researchgate.net/publicatio ... nd_HIV_RNA
Virtuose писал(а):Краткие выводы исследования - набор высокочувствительный, быстрый, простой и дешёвый. Касательно HCV - в исследование вошли 34 пробы плазмы с концентрацией вируса от 25 до 4.9x10^6 ме/мл. Изначальная Вирусная нагрузка (концентрация) определялась на системах Roche Diagnostics и ими же и были предоставлены образцы для тестирования AmpliSens. В итоге из 34 проб AmpliSens подтвердил 31 как HCV positive, а 3 оставшихся образца с нагрузкой от 25 до 59 ме/мл были определены им ошибочно негативными. Т.е. AmpliSens подтвердил все, что было с нагрузкой выше 60 ме/мл. В анализе использовали 1 мл плазмы, что равно 1000 мкл и соответсвует максимальной чувствительности в 10 ме/мл.
Все выводы сделанные в шведском исследование по оценке качественного мультиплекcа AmpliSens основаны исключительно на анализе клинических образцов.
Полное название исследования на английском звучит как - «Evaluation of the multiplex AmpliSens HCV/HBV/HIV-FRT rael-time PCR for simultaneous qualitative detection of Hepatitis C RNA, Hepatitis B DNA and HIV RNA in clinical plasma samples”. Или кратко: «CLINICAL PERFORMANCE EVALUATION of AmpliSens» - «КЛИНИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ПОКАЗАНИЙ АмплиСенс».
«Тестирование международных стандартов NIBSC» на которые ссылается vvp выше является неклиническим анализом показаний тест-набора - «NON-CLINICAL PERFORMANCE EVALUATION» - «НЕКЛИНЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ПОКАЗАНИЙ». И действительно данная оценка используется для валидации чувствительности тестов.

Вкратце о том, что собой представляет данная оценка.
National Institute for Biological Standards and Control (NIBSC) предоставляет/продаёт научным институтам, лабораториям, а также частным производителям тестов «стандарт» для проведения неклинических оценок показаний тест-наборов, для их валидации. Стандарт фасуется во флаконы, каждый флакон имеет одинаковое количество вируса/концентрацию. Для целей валидации тест-наборов стандарт разводят негативной плазмой (отрицательной по ДНК ВГВ, РНК ВГС и РНК ВИЧ) и проводят амплификацию, постепенно снижая концентрацию вируса в образце до недетектруемого уровня и таким образом определяется порог чувствительности теста-набора.

Именно таким образом была установлена паспортная чувствительность количественного теста COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan® HCV Test, v2.0, который имеется в арсенале ИНВИТРО (по данным Компании). Если посмотреть тех. паспорт данного теста, то на стр. 13 можно ознакомиться с результатом такой неклинической оценки, на основе которой и была определена чувствительность данного набора, которая составляет 15 МЕ/мл c 95% hit ratio.
https://pim-eservices.roche.com/eLD/(S( ... 215a9b3428
censored
Для каждой концентрации было проведено 252 повтора (колонка «Number of Valid Replicates»). В колонке «Number of Positives» представлены результаты положительных детекций, т.е. кол-во раз из 252 повторов, когда в образце был зафиксирован РНК ВГС. Так из таблицы с результатами выше видно, что в образце с концентрацией 50 МЕ/мл из 251 повтора тест зафиксировал РНК 251 раз, т.е. 100% попадание (hit ratio, крайняя правая колонка в таблице выше). Далее концентрация вируса в образце снижается до 25 МЕ/мл и процент попадания в данном случае так же равен 100%. Т.е. на данном этапе можно заключить, что со 100% вероятностью рошевский тест-набор детектирует вирус в образце с содержанием 25 МЕ/мл и выше. Следующая итерация производится с образцами, концентрация которых составляет 15 и 10 МЕ/мл и процент попадания при этом уже составляет 98 и 94% соответственно. Таким образом и был установлен паспортный порог чувствительности данного теста, который составил 15 МЕ/мл при hit ratio 95%. Доверительный интервал с 95% hit ratio составил от 10 до 13 МЕ/мл. Здесь же стоит отметить, что в образце с нижним значением концентрации вируса, которое составляет 2.5 МЕ/мл, данный тест смог задетектировать РНК в 48% повторений (121/251).

Теперь давайте вернемся к шведскому исследованию АмплиСенса и посмотрим на таблицу с результатами неклинической оценки по международным стандартам WHO. Таблица для удобства приведена ниже.
censored
Из таблицы видно, что начальная концентрация стандарта составляла 26 000 МЕ/мл, которая затем разводится 5 раз до концентрации 0.26 МЕ/мл, т.е. последовательно концентрация предыдущего образца снижается в 10 раз. В результате мы видим, что минимальной концентрацией, при которой АмплиСенс смог задетектировать вирус, является 2.6 МЕ/мл.

При этом в таблице выше отсутствует статистическая информация об общем количестве повторов и задетектированных повторах, что не позволяет сделать какие-либо выводы про вероятность и достоверность полученных результатов. Авторами шведского исследования также не приведены никакие-либо выводы и описание результатов оценки по стандартам WHO.

Комментарии, дополнения и замечания приветствуются!
Последний раз редактировалось Virtuose 04 июн 2016 00:54, всего редактировалось 1 раз.
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
vvp
Новичок
Сообщения: 99
Зарегистрирован: 10 май 2016 10:43
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Генотип: не определял(а)
Город: не дом и не улица
Благодарил (а): 5 раз
Поблагодарили: 28 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение vvp »

Все верно. По всей видимости, формат тезисов не позволял внести еще и результаты по NIBSC в текст, оставили только на постере.
Но некоторые выводы можно все же сделать и самим: разведения международных стандартов ВОЗ выявляются в очень низких концентрациях. Этих результатов, как верно замечено, недостаточно для полноценной валидации чувствительности теста в соответствии с евростандартами, но для оценки вполне (что и отражено в слове "Evaluation" в названии тезисов).
Umkanich
Новичок
Сообщения: 345
Зарегистрирован: 17 окт 2015 18:47
Пол:
Гепатит: C
Фиброз: F1
Генотип: 1
Город: Красноярск
Благодарил (а): 10 раз
Поблагодарили: 42 раза

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Umkanich »

Интересно, ну как минимум один раз амплисенс смог определить концентрацию в 2,6 МЕ на 31 цикле. Все же странно что в открытом доступе нет полного испытания тестов амплисенс как например у cobas.
Фиброскан 1, генотип 1, ПВТ с 24.01.16 СОФ+ДАК 12 недель (первые 4 недели АСУН)
ПЦР старт 1,4*10^6 , 5 день: (-)60 МЕ, 12 день: (-)47. УВО4
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

vvp писал(а):ПЦР выявляет РНК или ДНК вируса: если она попала в пробирку и виден сигнал, лаборатория выдает результат "обнаружено". Почему и как часто это может наблюдаться после терапии и почему при этом может достигаться УВО, вопросы к инфекционистам/фармацевтам/иммунитету организма.
vvp писал(а):гипотеза такова: реальная нагрузка у пациентов на/в конце успешной терапии в ряде случаев (частота? вопрос к врачам/пациентам) находится где-то ниже 15-20 МЕ/мл. Теми лабораториями, которые имеют наибольшую чувствительность анализа такие образцы выявляются чаще, заметьте, я говорю о лабораториях, а не реагентах, т.к. анализ проводится в конкретной лаборатории и может накладываться качество работы данной лаборатории.
vvp писал(а):Посредством успешной терапии размножение первых будет подавлено, но еще не успевшие элиминироваться "мертвые" остатки вирусных частиц теоретически могут быть причиной положительных результатов на ПЦР в течение некоторого времени. Главный вопрос здесь - как долго происходит элиминация этих остатков? Источник сверху говорит о 4-8 неделях. Естественно, этот период зависит и от чувствительности ПЦР-анализа. Должно быть, также важны длительность инфекции и значения вирусной нагрузки в процессе протекания инфекции, ну, и способности иммунитета организма, конечно.
Давайте посмотрим на результаты трёх КИ.
Первые КИ по 12 нед. SOF/DAC/RIB, Gen 3, F3/4.
«SOFOSBUVIR/DACLATSAVIR/RIBAVIRIN FOR 12 WEEKS IN PATIENTS WITH GENOTYPE 3 HEPATITIS C AND ADVANCED FIBROSIS/CIRRHOSIS: RESULTS FROM A REAL WORLD COHORT»
117 стр. [url]http://linkback.morganstanley.com/web/sendlink/webapp/f/48lii6g4-3pfn-g00j-a95b-005056013400?store=0&d=UwBSZXNlYXJjaF9NUwAwMDc4ZjRhYS1mNmZmLTExZTUtYmQyZS1hYmRhODUzZjA3NTI%3D&user=dc5x8vusckszb-19&__gda__=1585560191_840f1e1cf02277bb367ef5e8d5b5e597[/url]
Мониторились Abbott с чувствительностью 12 МЕ (нижний лимит количественного определения / подсчитываемая детекция – LLOQ). На 4 неделе ПВТ у 18 (69%) человек РНК был ниже порога чувствительности 12 МЕ (из них 8 недетектровались и 10 дтектировались) и 6 (31%) человек имели измеряемую виремию от 14 до 40 МЕ/мл). Одного пациента сняли с терапии, поскольку он хотел повеситься на 3 неделе. В итоге осталось 26 человек. Все 26 достигли EOT – т.е. на 12 нед. у 21 человека РНК не детектировалась и 5 человек с РНК дететруемой ниже лимита количественного определения – 12 МЕ. На момент публикации результатов данных КИ в апреле 2016 г. были доступны данные только по 19 пациентам. В результате 16 из 19 достигли УВО12, включая 4-ых из 5 у которых на 4 неделе количественно детектировался вирус и 4-ых из 5 у которых вирус детектировался ниже лимита количественного определения на 12 недели терапии. Выводы: Не измеряемая виремия на 4 неделе ПВТ, не дектируемая виремия <LLOQ в конце терапии не влияют на достижение УВО12!

Вторые КИ (приводил уже ранее) по разным генотипам. 12 недель, 467 человек на разных ингибиторных схемах (DAC/SOF/LED)
“Impact of direct acting antiviral therapy in patients with chronic hepatitis C and decompensated cirrhosis”


[url]http://www.natap.org/2016/HCV/PIIS0168827816000659.pdf[/url]

У 19 пациентов вирус детектировался на уровне ниже лимита количественного определения (30 МЕ/мл) после 12 недель терапии и затем 4 пациента ещё бипнули плюсом на 4 неделе после окончания терапии. 22 из этих 23 пациентов в результате достигли УВО-12, включая тех 4-ых, которые плюсовали на 4 неделе после окончания 12 нед. терапии. Выводов на этот счёт в статье нет.

Ну и 3-и, самые интересные КИ.
Называется «Полезность мониторинг вирусной нагрузки на ингибиторной терапии». «Utility of Hepatitis C Viral Load Monitoring On Directly Acting Antiviral Therapy»
[url]http://cid.oxfordjournals.org/content/early/2015/03/02/cid.civ170.full.pdf[/url]
В исследовании приняли участи наивные пациенты с 1-ым генотипом:
55 человек - SOF/RIB на 24 нед
20 человек - SOF/LED на 12 нед.
20 человек - SOF/LED/GS-9669 на 6 нед.
19 человек - SOF/LED/GS-9451 на 6 нед.
Вирусная нагрузка мониторилась двумя тестами (1) Roche COBAS TaqMan HCV и (2) Abbott RealTime HCV. LLOQ - 43 IU/mL (Roche) и 12 IU/mL (Abbott). Ниже LLOQ РНК ВГВ считается «неквантифицируемой / неподдающейся подсчету» и дальше может быть определена как «цель обнаружена - target detected (TD)» или «цель не обнаружена - target not detected (TND)».

Пропущу здесь описание результатов по 4 нед и перейду сразу на 12 нед. Остальное почитайте сами. Рекомендую.
Все 55 пациентов на SOF/RIB 24 нед. имели “цель не обнаружена ” или HCV RNA TND <LLOQ в конце терапии (24 нед.) по обоим тестам – Roche и Abbott. При этом SVR12 достигли только 38 человек - 69%.

Все о 59 пациентов, которые шли на SOF/LED+- GS-9669 и GS-9451 имели HCV RNA <LLOQ в конце ПВТ на Roche. Из 59 в результате был всего один «релапсер» из 6 недельной группы SOF/LED/GS-9669. Релапс произошёл между 2 и 4-ой неделей после окончания ПВТ.
При этом только 55 из 59 пациентов имели «цель не обнаружена» или НCV RNA TND <LLOQ в конце 12-ти или 6-ти недельной ПВТ. Т.е. 4 пациента на Roche имели «цель обнаружена» или HCV RNA TD <LLOQ. При этом из этих 4 пациентов «релапснул» только один (см. выше).
В сравнении с Roche по Abbot было меньше пациентов, которые имели HCV RNA <LLOQ в конце терапии – 53 из 59. Что очевидно, поскольку чувствительность у Abbott (LLOQ) выше почти в 4 раза. И 52 из этих 53 достигли УВО12. 30 из 59 имели в конце ПВТ «цель не обнаружена – target not detected (TND)» или НCV RNA TND <LLOQ и все 30 достигли УВО12. У 29 пациентов в конце ПВТ вирус был обнаружен ниже порога детекции «target detected (TD) или HCV RNA TD <LLOQ. У 3 пациентов из 12 недельной группы вирус продолжал детектировться ниже LLOQ до конца УВО2.
6 пациентов из тех, которые шли на 6 недельных терапиях в конце ПВТ имели вирусную нагрузку от 14 до 64 МЕ/мл (14/15/22/52/62/64) и никто из этих пациентов не релапснул (все достигли УВО12). Только 1 из 29 пациентов с HCV RNA ≥ LLOQ или HCV RNA TD <LLOQ релапснул.

6 пациентов у которых была «посчитанная» вирусная нагрузка от 14 до 64 МЕ/мл (14/15/22/52/62/64 МЕ/мл) в конце ПВТ достигли УВО12. При этом у 5 пациентов вирус ещё продолжал детектироваться количественно до конца 2-ой недели после окончания терапии (15/27/28/57/75 МЕ/мл). При этом пациент с нагрузкой 75 МЕ/мл не имел количественно детектируемого вируса в концу ПВТ и он в результате был единственным кто релапснул. Уже на 4-ой неделе после окончания ПВТ вирусная нагрузка у него была 161 635 МЕ/мл. У пациента с вирусной нагрузкой 57 МЕ/мл на 2-ой неделе после окончания терапии вирус продолжа количественно детектироваться (14 МЕ/мл) на 4 неделе после терапии и далее детектировался уже неколичественно вплоть до УВО8 и в результате он достиг УВО12. В целом у 5 пациентов из обоих 6-ти недельных групп вирус продолжал детектироваться ниже LLOQ до УВО8. Дальше измерения делались уже на только УВО12.
ВЫВОДЫ: Тестирование во время и в конце терапии клинически бесполезно для целей предсказаний УВО12 на ингибиторных терапиях и так же для установления сроков таких терапий (т.е. бессмысленно продлять и усиливать при получении «+» в конце терапии). Результаты свидетельствуют, что ликвидация вируса (УВО) может быть достигнута даже в случае, когда РНК ВГС не до конца подавлена ингибиторами. Авторы исследования предполагают два возможных объяснения этому. (1) наличие детектируемого вируса в конце терапии у пациентов, которые в результате достигают УВО12, может быть объяснено ролью иммунной системы организма, которая продолжает настойчиво работать после прекращения терапии (в оригинале «may be explained by a role of the host immune system that persists after cessation of therapy».), (2) также это может объясняться тем, что в крови детектируются неинфекционные вирусные частицы, которые синтезируются в присутствии агентов, которые блокируют репликацию HCV комплексообразование (дословно «It may also be explained by the detection of non-infectious viral particles synthesized in the presence of agents that disrupt HCV replication complex formation»).

ОБЩИЙ ВЫВОД - ПЕРЕСТАНЬТЕ КОРМИТЬ ЛАБЫ, ЗАБУДЬТЕ ПРО ВСЕ ЭТИ «ЖУЛЬТРЫ» ИЗ-ЗА КОТОРЫХ ВЫ НЕОБОСНОВАННО ПРОДЛЕВАЕТЕСЬ И УСИЛИВАЕТЕСЬ!!! СДАВАЙТЕ САМЫЕ ОБЫЧНЫЕ «КАЧЕСТВЕННЫЕ» НА 4/8/12 НЕД И ТОЧНО ТАКЖЕ НА УВО-2/4/8/12. ВСЁ!
Вложения
TD, target detected - вирус обнаружен; TND, target not<br />detected - вирус не обнаружен
TD, target detected - вирус обнаружен; TND, target not
detected - вирус не обнаружен
Последний раз редактировалось Virtuose 15 июн 2016 21:45, всего редактировалось 10 раз.
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

Рассуждения:
  • 1. Почему в ИНВИТРО количественный РОШевский тест с чувствительностью 15 МЕ/мл ни разу «незадетектировал» вирус после плюсов на Амплисенсе с 10 МЕ и Реалбесте с 15 МЕ?
    2. У обоих тест-наборов (Амплисенс и Реалбест) одни и те же разработчики, значит они схожи технологически.
    3. Почему ЦМД не делает количественный тест с чувствительностью 10 МЕ? С момента появления качественного теста с чувствительностью 10 МЕ прошло почти 5 лет. Почему за это время не смогли сделать кол-во с 10 МЕ.
    4. Роспотребнадзор производит количественный Амплисенс набор с чувствительностью 30 МЕ (при условии выделения РНК из 1 мл плазмы) – почему его нет в линейке ЦМД?
    5. ПЦР диагностика явно отстает от развития фармы. Не умеют пока тест-наборы отличать живую РНК от неинфекционных вирусных частиц. Возможно, Амплисенс и Реалбест больше всех в мире преуспели в отлавливании «мёртвых частиц» и могли бы поделиться этим опытом с Abbott или Roche – обменять навыки по отлавливанию мертвых частиц на живых :t:
вот пример - человек с желтого, который до сих пор плюсует на РеалБесте, до этого плюсовал на Амплисенсе. Параллельно перепроверяется на количественном Роше с 15 ме в ИНВИТРО. Сейчас идёт 21 неделя теры. Решил продлиться с 24 до 28 недель из-за "плюсов", котрые получает всю теру - до 11 неделе в ЦМД на Амплисенсе, а после от местной лабы на РеалБесте. 20 нед плюсы на квадро тере :wac:

Старт 15.01.2016 : Софосбувир + Даклатасвир + Рибавирин. С 10 недели Пегасис 180мкг.
0 неделя - Количество: (8,3x10^5 Ме/мл); Алт:93; Аст:48 - Лаборатория Ф51 (Садко)
1 неделя - Количество: (410 Ме/мл); Алт:46; Аст:23 - ЦМД
2 неделя - Качество: (+) (чувствительность 100Ме/мл); Алт: 27; Аст:21 - ЦМД
3 неделя - Качество: (+) (чувствительность 100Ме/мл); Алт: 21; Аст:19 - ЦМД
4 неделя -Качество: (+) (чувствительность 60Ме/мл) - Инвитро
5 неделя - Количество: (<100 Ме/мл) (диапазон от 100 Ме/мл); Алт:16; Аст:18 - Инвитро
6 неделя - Качество: (-) (чувствительность 60Ме/мл); Алт:17; Аст:16 - Инвитро
7 неделя - Качество: (+) (чувствительность 10Ме/мл) - ЦМД
8 неделя - Качество: (+) (чувствительность 10Ме/мл) - ЦМД
-Качество: (-) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
9 неделя - Качество: (+) (чувствительность 10Ме/мл); Алт: 13; Аст:16 - ЦМД
-Качество: (+) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
10 неделя - Качество: (+) (чувствительность 10Ме/мл) - ЦМД
-Качество: (-) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
11 неделя - Качество: (+) (чувствительность 10Ме/мл) - ЦМД
-Качество: (+) (чувствительность 15Ме/мл); Алт: 17; Аст:19 - Ника спринг
12 неделя - Качество (-) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
13 неделя - Качество (+) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
14 неделя - Качество (+) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
15 неделя - Количество: (-) (диапазон от 15 Ме/мл); Алт:23; Аст:23 - Инвитро
-Качество: (+) (чувствительность 10Ме/мл) - ЦМД
-Качество (обнаружено <15Ме/мл) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
16 неделя - Качество: (-) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
17 неделя - Качество (обнаружено <15Ме/мл) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
18 неделя - Качество (обнаружено <16Ме/мл) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
19 неделя - Количество: (-) (диапазон от 15 Ме/мл) - Инвитро
-Качество: (-) (чувствительность 15Ме/мл) - Ника спринг
20 неделя-Качество: Качество (обнаружено <15Ме/мл); Алт: 22; Аст:22 - Ника спринг
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
vvp
Новичок
Сообщения: 99
Зарегистрирован: 10 май 2016 10:43
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Генотип: не определял(а)
Город: не дом и не улица
Благодарил (а): 5 раз
Поблагодарили: 28 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение vvp »

Virtuose писал(а):Рассуждения:
  • 1. Почему в ИНВИТРО количественный РОШевский тест с чувствительностью 15 МЕ/мл ни разу «незадетектировал» вирус после плюсов на Амплисенсе с 10 МЕ и Реалбесте с 15 МЕ?
    2. У обоих тест-наборов (Амплисенс и Реалбест) одни и те же разработчики, значит они схожи технологически.
    3. Почему ЦМД не делает количественный тест с чувствительностью 10 МЕ? С момента появления качественного теста с чувствительностью 10 МЕ прошло почти 5 лет. Почему за это время не смогли сделать кол-во с 10 МЕ.
    4. Роспотребнадзор производит количественный Амплисенс набор с чувствительностью 30 МЕ (при условии выделения РНК из 1 мл плазмы) – почему его нет в линейке ЦМД?
    5. ПЦР диагностика явно отстает от развития фармы. Не умеют пока тест-наборы отличать живую РНК от неинфекционных вирусных частиц. Возможно, Амплисенс и Реалбест больше всех в мире преуспели в отлавливании «мёртвых частиц» и могли бы поделиться этим опытом с Abbott или Roche – обменять навыки по отлавливанию мертвых частиц на живых :t:
вот пример - человек с желтого, который до сих пор плюсует на РеалБесте, до этого плюсовал на Амплисенсе. Параллельно перепроверяется на количественном Роше с 15 ме в ИНВИТРО. Сейчас идёт 21 неделя теры. Решил продлиться с 24 до 28 недель из-за "плюсов", котрые получает всю теру - до 11 неделе в ЦМД на Амплисенсе, а после от местной лабы на РеалБесте. 20 нед плюсы на квадро тере :wac:
1. Вопрос может быть адресован как производителям и поставщикам реагентов, так и исполнителям анализа. Самый простой и правдивый ответ здесь: потому что в одном месте поймали такую концентрацию вируса, а в другом нет. Но истинной правды здесь не найти.
2. Если под разработчиками понимать российских научных сотрудников, то конечно у Амплисенс и Реалбест одни и те же разработчики, но вообще это разные коллективы, хотя бы силу того, что находятся в 3000 км друг от друга. Принцип анализа одинаков у всех обсуждаемых здесь тестов, это не от разработчиков зависит, а от самой технологии ПЦР.
3. Количественный тест от 10 МЕ/мл, будет очень неточным вблизи этих 10 МЕ/мл.
4. Видимо, был недостаточный спрос, возможно, когда спрос перейдет определенный порог, такой тест появится в списке анализов.
5. Еще раз повторю, что вся вирусная РНК/ДНК является неживой, до тех пор пока не попадет в живую клетку и не начнет экспрессироваться клеточным ферментативным аппаратом. С точки зрения же ПЦР (любого ПЦР-теста, вне зависимости от производителя) нет разницы откуда появилась РНК/ДНК: есть участок для амплификации, реакция будет идти. Вопрос лишь в пределе детекции теста и достижении этого предела в конкретной лаборатории.

Про квадротерапию:
Т.е. теперь и другие лабы начали давать "ложноположительные" результаты?
Последний раз редактировалось vvp 06 июн 2016 21:59, всего редактировалось 2 раза.
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

vvp писал(а):5. Еще раз повторю, что вся вирусная РНК/ДНК является неживой, до тех пор пока не попадет в живую клетку и не начнет экспрессироваться клеточным ферментативным аппаратом. С точки зрения же ПЦР (любого ПЦР-теста, вне зависимости от производителя) нет разницы откуда появилась РНК/ДНК: есть участок для амплификации, реакция будет идти. Вопрос лишь в пределе детекции теста и достижении этого предела в конкретной лаборатории.
я тоже повторю, что имеется в виду под "мертвыми частицами" -
Virtuose писал(а):Результаты свидетельствуют, что ликвидация вируса (УВО) может быть достигнута даже в случае, когда РНК ВГС не до конца подавлена ингибиторами. Авторы исследования предполагают два возможных объяснения этому. (2) также это может объясняться тем, что в крови детектируются неинфекционные вирусные частицы, которые синтезируются в присутствии агентов, которые блокируют репликацию HCV комплексообразование (дословно «It may also be explained by the detection of non-infectious viral particles synthesized in the presence of agents that disrupt HCV replication complex formation»).
vvp писал(а):Про квадротерапию:
Т.е. теперь и другие лабы начали давать "ложноположительные" результаты?
как видите из примера выше....

Если ещё раз внимательно посмотреть на результаты КИ, которые я привёл выше, то даже не имея аналитических способностей, которыми обладает ЕгорМ :t: , можно обратить внимание на то, что чем длиннее терапия, тем менее коротким является период после окончания терапии, когда может все ещё детектироваться вирус. Во всех случаях на 12 недельных терапиях с минимум двумя ингибиторами РНК ВГС детектировалась максимум до 4 нед после окончания терапии на Abbott c 12 ме. По 6-ти недельным КИ РНК ВГС детектировался вплоть до 8 недели после окончания терапии. Поэтому "плюсы" на 20 неделе квадратной терапии, которые не подтверждаются высокочувствительным Рошем, выглядят вдвойне подозрительными и сомнительными...
Последний раз редактировалось Virtuose 06 июн 2016 23:43, всего редактировалось 1 раз.
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
vvp
Новичок
Сообщения: 99
Зарегистрирован: 10 май 2016 10:43
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Генотип: не определял(а)
Город: не дом и не улица
Благодарил (а): 5 раз
Поблагодарили: 28 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение vvp »

Virtuose писал(а):я тоже повторю, что имеется в виду под "мертвыми частицами"

Я понимаю, что там имеется, я же сам аналогично теоретизировал на эту тему. Важно, что для любой ПЦР, хоть русской, хоть американской, неважно, откуда пришла РНК/ДНК.
Virtuose писал(а):
vvp писал(а):Про квадротерапию:
Т.е. теперь и другие лабы начали давать "ложноположительные" результаты?
как видите из примера выше....

Если ещё раз внимательно посмотреть на результаты КИ, которые я привёл выше, то даже не имея аналитических способностей, которыми обладает ЕгорМ :t: , можно обратить внимание на то, что чем длиннее терапия, тем менее коротким является период после окончания терапии, когда может все ещё детектироваться вирус. Во всех случаях на 12 недельных терапиях с минимум двумя ингибиторами РНК ВГС детектировалась максимум до 4 нед после окончания терапии на Abbott c 12 ме. По 6-ти недельным КИ РНК ВГС детектировался вплоть до 8 недели после окончания терапии. Поэтому "плюсы" на 20 неделе квадратной терапии, которые не подтверждаются высокочувствительным Рошем выглядет вдвойне подозрительными и сомнительными...
Хорошо, давайте внимательно смотреть.
SVR12 - virological response at 12 weeks post-treatment, как обозначено в названии таблицы, т.е. через 12 недель после окончания терапии
Далее, например, в приведенных КИ2 SVR12 достигается только для 81,6% (381 из 467) (Table 2)
Но надо отметить, что там когорта пациентов была тяжелая: 406 с циррозом (decompensated cirrhosis)
Последний раз редактировалось vvp 07 июн 2016 01:07, всего редактировалось 1 раз.
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

vvp писал(а):SVR12 - virological response at 12 weeks post-treatment, как обозначено в названии таблицы, т.е. через 12 недель после окончания терапии
и? :t:
Т.е. чтобы делать такие выводы необходимо закончить терапию? Вы к этому? Ок, тогда ингибиторы сами провоцируют наличие "детектируемого материала"? Пока ешь Инги вирус будет детектироваться всегда? Будь то 6,12,24 или 40 и больше недель? Тогда это возвращает к вопросу о том, что же все-таки анализирует ПЦР, т.е. к вашему ответу на мой вопрос под номер 5 выше.
vvp писал(а):Далее, например, в приведенных КИ2 SVR12 достигается только для 81,6% (381 из 467) (Table 2)
да, но в этих КИ все те, кто плюсовал в конце терапии и на 4 неделе после получили УВО12 (22/23). Т.е. релапсерами были те, кто как раз-то не "плюсовал" в конце терапии и до 4 недели после неё. Вы хотите сказать, что все те, кто не получил УВО12 в любом случае имели детектируемую РНК но просто на эстремально низком уровне, что Abbott 12 ме не мог их определять?
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
vvp
Новичок
Сообщения: 99
Зарегистрирован: 10 май 2016 10:43
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Генотип: не определял(а)
Город: не дом и не улица
Благодарил (а): 5 раз
Поблагодарили: 28 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение vvp »

Virtuose писал(а):
vvp писал(а):SVR12 - virological response at 12 weeks post-treatment, как обозначено в названии таблицы, т.е. через 12 недель после окончания терапии
и? :t:
Т.е. чтобы делать такие выводы необходимо закончить терапию? Вы к этому?
Если уж мы говорим об УВО12, то это 12 недель после окончания терапии, а не 4 или 8, как Вы писали ранее. И УВО12 достигалось не у 100% пациентов в приведенных КИ. Я только лишь об этом.
Ок, тогда ингибиторы сами провоцируют наличие "детектируемого материала"? Пока ешь Инги вирус будет детектироваться всегда? Будь то 6,12,24 или 40 и больше недель?
Нет, ингибиторы лишь блокируют работу вирусных ферментов, закодированных в его РНК. По сути, не дают образовываться новым вирусным частицам.
Тогда это возвращает к вопросу о том, что же все-таки анализирует ПЦР, т.е. к вашему ответу на мой вопрос под номер 5 выше.
ПЦР анализирует относительно небольшой фрагмент генома вируса в исследуемом образце.
Вы хотите сказать, что все те, кто не получил УВО12 в любом случае имели детектируемую РНК но просто на эстремально низком уровне, что Abbott 12 ме не мог их определять?
Все те, кто не получил УВО12, по определению должны иметь детектируемую вирусную нагрузку на 12 неделе после окончания терапии, ибо если она недетектируемая, то как раз достигается УВО12.
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

vvp писал(а):Если уж мы говорим об УВО12, то это 12 недель после окончания терапии, а не 4 или 8, как Вы писали ранее. И УВО12 достигалось не у 100% пациентов в приведенных КИ.
да, это я прекрасно понимаю. Все что я говорю, что "Во всех случаях на 12 недельных терапиях с минимум двумя ингибиторами РНК ВГС детектировалась максимум до 4 нед после окончания терапии. По 6-ти недельным КИ РНК ВГС детектировался вплоть до 8 недели после окончания терапии." В 3 КИ УВО достигли все 20 пациентов. Во 2-Ом КИ я написал выше "да, но в этих КИ все те, кто плюсовал в конце терапии и на 4 неделе, после получили УВО12 (22 из 23). Т.е. релапсерами (те кто не получил УВО12) были те, кто как раз-то не "плюсовал" в конце терапии и до 4 недели после неё. В 1-Ом КИ результатов УВО12 ещё нет по всем пациентам, но по 16-ти уже подтвержден УВО, включая 4 из 5, которые плюсовали в конце терапии. Не понимаю, как все это мешает моему наблюдению относительно "чем длиннее КИ, тем короче срок после прекращения приема ингибиторов, когда вирус все ещё детектируется....?
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

vvp писал(а):Все те, кто не получил УВО12, по определению должны иметь детектируемую вирусную нагрузку на 12 неделе после окончания терапии, ибо если она недетектируемая, то как раз достигается УВО12.
Я говорил про конец терапии и период после окончания терапии - от 2 до 8 нед. А не про 12 неделю после окончания. Перечитайте, пожалуйста, мой вопрос в контексте. Тролить и умничать я тоже могу :yes:
Последний раз редактировалось Virtuose 07 июн 2016 01:54, всего редактировалось 1 раз.
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
vvp
Новичок
Сообщения: 99
Зарегистрирован: 10 май 2016 10:43
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Генотип: не определял(а)
Город: не дом и не улица
Благодарил (а): 5 раз
Поблагодарили: 28 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение vvp »

Virtuose писал(а):
vvp писал(а):Все те, кто не получил УВО12, по определению должны иметь детектируемую вирусную нагрузку на 12 неделе после окончания терапии, ибо если она недетектируемая, то как раз достигается УВО12.
Я говорил про конец терапии и период после окончания терапии - от 2 до 8 нед. А не про 12 неделю после окончания. Перечитайте, пожалуйста, мой вопрос в контексте. Тролить и умничать я тоже могу :yes:
Я отвечал где-то троллингом? Я ответил ровно на то, что прочитал?
Познакомившись с КИ2 (КИ1 я даже смотреть не стал, 170 страниц все-таки), увидел, что УВО12 не у 100%. И удивился, зачем же вообще говорить о 2 и 8 неделях после окончания терапии, если даже на 12 не у всех УВО?
Virtuose
Местный
Сообщения: 775
Зарегистрирован: 14 апр 2014 23:52
Пол:
Гепатит: Гепатита нет
Фиброз: F0
Генотип: не типируется
Город: Герой
Благодарил (а): 51 раз
Поблагодарили: 196 раз

Re: ЦМД - династия и её научное наследие...

Сообщение Virtuose »

vvp писал(а):Я отвечал где-то троллингом? Я ответил ровно на то, что прочитал?
Познакомившись с КИ2 (КИ1 я даже смотреть не стал, 170 страниц все-таки), увидел, что УВО12 не у 100%. И удивился, зачем же вообще говорить о 2 и 8 неделях после окончания терапии, если даже на 12 не у всех УВО?
Ок, может показалось. Извините.
Я переформулирую свой вопрос. Как вы считаете, все те кто не достигают УВО имеют РНК ВГС в крови на протяжении всей терапии? Просто современные тест-наборы не позволяют определить РНК на сверхнизких уровнях? Вроде бы логично, что раз УВО не достигнуто, значит вирус в крови был всегда, а иначе это было бы повторным заражением во время терапии, что вряд ли в большинстве случаев. Тогда как объясняется тот фак, что во 2-м КИ почти все те, у кого РНК детектировалась в конце терапии и до 4 неделе после окончания терапии в результате получили УВО12? Т.е. неответчики как раз представлены теми пациентами, у которых вирус недетектировался в конце терапии и поле её окончания, до УОВ12.
Virtuose писал(а):У 19 пациентов вирус детектировался на уровне ниже лимита количественного определения (30 МЕ/мл) после 12 недель терапии и затем 4 пациента ещё бипнули плюсом на 4 неделе после окончания терапии. 22 из этих 23 пациентов в результате достигли УВО-12, включая тех 4-ых, которые плюсовали на 4 неделе после окончания 12 нед. терапии. Выводов на этот счёт в статье нет.
В 3 КИ все 55 человек, кто шёл 24 нед. на Соф-дак имели по обоим тестам Abbott и Roche минус в конце терапии и при этом УВО получили лишь 69%. Т.е. По факту у 31% был в крови РНК на конец 24 нед терапии, но вирус был в таком минимально кол-ве, что даже Abbott не мог его определить? Спасибо
открыть спойлерЛабы - тест-наборы и чувствительность
viewtopic.php?f=4&t=17516 - ВЫВОДЫ НА 18 СТР.
открыть спойлерУВО-68
3 ген. Ф-0
1-ая ПВТ 2014 - 24 нед Пег/Риб - возврат
2-ая ПВТ 2015 - 24 нед Соф/Даклинза/Риб/Пег-первые 12 нед
Ответить